Program studi Pendidikan Agama Islam di Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah Al-Quraniyah Manna adalah program studi yang tertua, dibuka sejak berdiri tahun 1995. sudah banyak mengeluarkan alumni yang tersebar di berbagai penjuru dalam wilayah Provinsi Bengkulu umumnya dan Kabupaten Bengkulu Selatan pada khususnya. bekerja pada berbagai bidang, baik pada bidang yang sesuai dengan disiplin keilmuannya maupun bekerja pada bidang yang lainnya seperti pedagang, tenaga adminstrasi diperkantoran bahkan politisi dan lainnya.